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Le Comité interinstitutionnel (C2I) a un rôle co-décisionnaire, en lien direct avec le comité exécutif (COMEX). Il regroupe les institutions représentant les principaux organismes nationaux de recherche et établissements d'enseignement supérieur et de recherche fortement impliqués dans la recherche forestière en France et dans les zones tropicales (INRAE, CIRAD, CNRS, IRD, UM, UL, APT, IGN, ONF, CNPF). Sous la présidence d'INRAE, les directeurs généraux de ces différentes institutions (ou leurs représentants) prennent les décisions concernant les orientations stratégiques du programme. Ils se réunissent annuellement pour définir, hiérarchiser et valider les orientations scientifiques proposées par le Comité exécutif (tels que des changements de stratégie scientifique, de hiérarchisation des actions ou d'allocation des ressources). Ils veillent à ce que ces orientations s'inscrivent dans les stratégies de leurs institutions et servent la communauté scientifique dans son ensemble. Leurs décisions seront fondées non seulement sur les propositions du Comité exécutif, mais aussi sur les avis émis par le Comité des parties prenantes.

Composition :

• INRAE : Carole Caranta – Directrice Générale déléguée Science et Innovation
• Université de Lorraine : Eric Gelhave – Directeur du pôle scientifique A2F (Agronomie, Agroalimentaire, Forêt)
• CNRS : Agathe Euzen – Directrice Adjointe de l’INEE, en charge du suivi des PEPR
• CIRAD : Thierry Fourcaud - Directeur Général Délégué Adjoint à la Recherche et à la Stratégie
• Université de Montpellier : Jacques Mercier – VP Recherche
• AgroParisTech : Myriam Legay – Directrice du Campus APT de Nancy
• IRD : Jean-Christophe Avarre – Directeur Adjoint du département ECOBIO
• ONF : Valérie Métrich-Hecquet – Directrice Générale (suppléant Oliver Rousset, Directeur Général Adjoint)
• CNPF : Roland De Lary – Directeur Général
• IGN : Nicolas Paparoditis – Directeur Général Adjoint